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by @endotaishi_

作業のための準備作業を1日かけて行なった記録

Mar 24, 2024

たまには時間をかけて準備することが大事だって皆さんも知っていると思うｿﾞ。

ﾎﾟは3月16日から21日まで生態学会に参加して、ﾎﾟｽﾀｰ発表を行ったｿﾞ（ｵﾝﾗｲﾝで）。

昨年末からずっと続けた研究をやっとの思いで発表したんだけど、その期間に書き散らかしたﾌﾟﾛｸﾞﾗﾑがもう・・・・・

ﾎﾟは今年度ももちろん研究を続けるから、新学期が始まる前にﾌﾟﾛｸﾞﾗﾑの整理を行ったｿﾞ。

つまり今回は、新学期に新しくする作業に備えての作業を1日かけて行なった話だｿﾞ。

Python環境構築（pyenv+poetry）

pyenv

Pythonのバージョンを管理するツール。異なるプロジェクトで異なるPythonのバージョンを使用したい場合に便利。
システムに複数のPythonバージョンをインストールして切り替えることができる。
ローカルとグローバル、それぞれのプロジェクトで異なるPythonバージョンを簡単に設定できる。

poetry

パッケージの依存関係管理とプロジェクトのビルドを行うツール。
依存関係の解決とパッケージのインストールがシームレスに行える。
pyproject.tomlを使って設定を一箇所にまとめられる。
仮想環境の管理もサポート。

（引用：chatGPT）

つまり、pyenv+poetryで環境構築することで、pythonのヴァージョンを管理しながら、プロジェクトごとのパッケージの管理ができるんだｿﾞ。

さらにpoetryは自動で仮想環境の作成まで行ってくれるｿﾞ。

ﾎﾟはvenv（python標準の仮想環境）も使おうかと思ったけど、ゼミ内での共有が面倒になりそうだから今回はやめておいたｿﾞ。

それぞれのｲﾝｽﾄｰﾙ方法は公式ﾄﾞｷｭﾒﾝﾄを参考にしたｿﾞ。

ﾃﾞｨﾚｸﾄﾘ構成の見直し

ﾎﾟはﾃﾞｨﾚｸﾄﾘの構成も見直したｿﾞ。

~
|- data
|	|- 整形後データが色んなフォルダに分かれてる
|- out
|	|- 実験データ
|- src
|	|- __pycache__
|	|- data
|	|	|- ロウデータを実験用に整形するプログラム
|	|- mylib
|	|	|- 実験用自作モジュール
|	|- visualization
|	|	|- グラフ描画用のプログラム
|	|- main.py
|- poetry.lock
|- pyproject.toml
|- README.md

ROWﾃﾞｰﾀは研究室のｺﾝﾋﾟｭｰﾀ何台かに保存してあるｿﾞ。

そこから複製したﾃﾞｰﾀは、~/src/dataにあるﾌﾟﾛｸﾞﾗﾑを使って実験用に整形するｿﾞ。

main.pyで実験を行ったら、あとは~/src/visualization/にあるﾌﾟﾛｸﾞﾗﾑを実行して、ｸﾞﾗﾌを描画するだけだｿﾞ。

簡単に見えるけど、たくさんﾃﾞｰﾀとﾌﾟﾛｸﾞﾗﾑがあって、散在してたからﾎﾟが1日かけてまとめたんだｿﾞ。

pyproject.tomlはpoetryを使うと自動で作られるやつで、ﾊﾟｯｹｰｼﾞの依存関係を管理しているｿﾞ。

ﾌﾟﾛｸﾞﾗﾑのｳﾞｧｰｼﾞｮﾝ管理はgit/githubを使って行っているｿﾞ。